入学早々、ぶっとんだ挨拶をかました涼宮ハルヒ。退屈な日常にあきたらない彼女は、「世界を大いに盛り上げるための涼宮ハルヒの団」通称SOS団なる不思議軍団を結成したのだ。
そんな彼女に巻き込まれたのが、クラスメイトのキョン、無口な読書少女・長門有希、萌え担当の朝比奈みくる、謎の転校生・古泉一樹。だが、キョン以外の３人には、ハルヒには言えない秘密があるようで……。
天上天下唯我独尊超ポジティブワガママ娘のハルヒに振り回されるキョンとSOS団が繰り広げる、ビミョーに非日常学園ストーリー！
涼宮ハルヒ すずみやはるひ
「楽しいこと」を追及する天下御免のＳＯＳ団の団長。団員の連中曰く、ハルヒには本人が知らない大きな秘密があるらしい……。
キョン きょん
この物語の語り手にしてハルヒの最大の被害者。いつのまにか「やれやれ」が口グセになってしまった雑用係のヒラ団員。
朝比奈みくる あさひなみくる
童顔な萌えキャラを評価されて、強引にハルヒに連れてこられたＳＯＳ団唯一の上級生。純真無垢な性格で団の癒し担当。
長門有希 ながとゆき
元々は文芸部の部員だったが、部室をハルヒに乗っ取られ、なし崩し的に入団させられた。無口かつ無表情、本ばかり読んでいる。
古泉一樹 こいずみいつき
高校一年の一学期に転入してきただけの理由で「謎の転校生」としてハルヒにスカウトされた。曖昧な笑顔がトレードマーク。
